western blot出现很多杂带,求助,交流

2024-05-15

1. western blot出现很多杂带,求助,交流

1.因为WB的一抗识别的蛋白质的表位是顺序表位,不是空间表位,所以WB状态下的抗原-抗体识别,与非变性的生理条件下的抗原-抗体识别不同。
2.WB之前,先用分子筛纯化同时也是检测一下目的蛋白产物是否成功。也就是目的蛋白是否成功表达了,而且在提取后稳定存在了。
3.非特异性的条带分子量偏大可能是SDS PAGE出的问题,胶的浓度不合适或者样品溶解度不够或者电泳时间不合适等,造成了目的条带的表观质量变大。
4.三个非特异性的分子量偏大条带之一可能是目的蛋白在SDS PAGE出的问题出了问题,另外两个带可能本来就是杂带了。可以回收后对三条带用质谱检测精确的分子量加以确定。
5.三个非特异性的分子量偏大条带至少应该有杂带,杂带出现而且与一抗相互作用,那么只能说杂带的顺序表位也能被一抗识别,必须更换专一性更高的抗体。
6.还有考虑你的镍柱亲和分离的问题,是不是获得了你的需要的目的蛋白质。

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2. PCR目的条带的问题,急!

恐怕还是cDNA的问题,actin因为量比较丰富,所以即使破坏一些仍能P出来,但你的目的基因就不同了

3. pcr需要注意的问题

1、PCR产物的电泳检测时间:一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚至消失。
2、假阴性,不出现扩增条带
模板:模板中含有杂蛋白质,模板中含有Taq酶抑制剂,模板中蛋白质没有消化除净,特别是染色体中的组蛋白,在提取制备模板时丢失过多,或吸入酚。
模板核酸变性不彻底。在酶和引物质量好时,不出现扩增带,极有可能是标本的消化处理,模板核酸提取过程出了毛病,因而要配制有效而稳定的消化处理液,其程序亦应 固定不宜随意更改。
酶失活:需更换新酶,或新旧两种酶同时使用,以分析是否因酶的活性丧失或不够而 导致假阴性。需注意的是有时忘加Taq酶或溴乙锭。
引物:引物质量、引物的浓度、两条引物的浓度是否对称,是PCR失败或扩增条带不 理想、容易弥散的常见原因。有些批号的引物合成质量有问题,两条引物一条浓度高,一条浓度低,造成低效率的不对称扩增。
对策为:选定一个好的引物合成单位。引物的浓度不仅要看OD值,更要注重引物原液做琼脂糖凝胶电泳,一定要有引物条带出现,而且两引物带的亮度应大体一致,如一条引物有条带,一条引物无条带,此时做PCR有可能失败,应和引物合成单位协商解决。
如一条引物亮度高,一条亮度低,在稀释引物时要平衡其浓度。引物应高浓度小量分装保存,防止多次冻融或长期放冰箱冷藏部分,导致引物变质降解失效。引物设计不合理,如引物长度不够,引物之间形成二聚体等。
Mg2+浓度:Mg2+离子浓度对PCR扩增效率影响很大,浓度过高可降低PCR扩增的特 异性,浓度过低则影响PCR扩增产量甚至使PCR扩增失败而不出扩增条带。
反应体积的改变:通常进行PCR扩增采用的体积为20ul、30ul、50ul。或100ul,应用多大体积进行PCR扩增,是根据科研和临床检测不同目的而设定,在做小体积如20ul 后,再做大体积时,一定要模索条件,否则容易失败。
靶序列变异:如靶序列发生突变或缺失,影响引物与模板特异性结合,或因靶序列某 段缺失使引物与模板失去互补序列,其PCR扩增是不会成功的。
3、假阳性
出现的PCR扩增条带与目的靶序列条带一致,有时其条带更整齐,亮度更高。
引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行PCR扩增时,扩增出的PCR产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性。需重新设计引物。
靶序列或扩增产物的交叉污染:这种污染有两种原因:一是整个基因组或大片段的交叉污染,导致假阳性。这种假阳性可用以下方法解决:操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样枪内或溅出离心管外。除酶及不能耐高温的物质外,所有试剂或器材均应高压消毒。
所用离心管及样进枪头等均应一次性使用。必要时,在加标本前,反应管和试剂用紫外线照射,以破坏存在的核酸。二是空气中的小片段核酸污染,这些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,与引物互补后,可扩增出PCR产物,而导致假阳性的产生,可用巢式PCR方法来减轻或消除。

4、出现非特异性扩增带
PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带与非特异性扩增带。非特异性条带的出现,其原因:一是引物与靶序列不完全互补、或引物聚合形成二聚体。二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低,及PCR循环次数过多有关。
其次是酶的质和量,往往一些来源的酶易出现非特异条带而另一来源的酶则不出现,酶量过多有时也会出现非特异性扩增。其对策有:必要时重新设计引 物。减低酶量或调换另一来源的酶。降低引物量,适当增加模板量,减少循环次数。
5、出现片状拖带或涂抹带
PCR扩增有时出现涂抹带或片状带或地毯样带。其原因往往由于酶量过多或酶的质量 差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多引起。其对策有:减少酶量,或调换另一来源的酶。减少dNTP的浓度。适当降低Mg2+浓 度。增加模板量,减少循环次数。
参考资料来源:百度百科-PCR扩增

pcr需要注意的问题

4. 为什么 pcr后有两条带???拜托了各位 谢谢

能否详细描述一下两条带的位置,另外你以什么作为template?cDNA?  因为一般情况下引物二聚体的条带都是或多或少的存在的。  如果是目的条带有两条,那么可能是引物出现了错配,也有可能是本身就有两种可能。回收测序即可。   追问:  两条带距离很近,一条很亮一条很暗,用的DNA基因组   回答:   基因组DNA的话有杂带几乎不可避免,因为错配可能很大,挺正常的。  如果两条带距离很近、又基本符合你目的片段的大小的话,可以继续跑胶让它们分开一些,然后切胶回收,连接T载体,转化涂板,挑菌测序。挑对的就行了。

希望采纳

5. PQE30酶切后几条带?

这个这样看你用几个酶切了,PQE30是环状的,单酶切就应该是变成直链的就是一条带,双酶切质粒就应该跑出两条带。 
前提是酶切的彻底,如果不彻底,还有杂带。

PQE30酶切后几条带?

6. 基因组PCR扩增条带很宽可能的是什么原因?有哪些可以解决的方案?(连续几次实验做出来的条带都比较宽)

很宽极有可能是扩增出两个或多个大小相近的片段,这种片段测序结果往往都是乱封,是多个序列测序结果叠加在一起的。解决办法,更换特异引物,或者胶浓度加大,比如2%的。电泳时间久一些,比如40分钟,就有可能将其分开,然后再切胶回收。

7. WB杂出来的actin为什么两条带

出现两条带是非常正常的现象.
抗体的原因:不同厂家的抗体特异性会出现不同的差异,大部分都能检测到目的条带,但是有时能检测到非特异性的条带;
蛋白亚型表达的原因:我做了大概两年半的WB,经常会发现,一种蛋白有时检测压型很明显,有时不是很明显.参考了很多文献的结果,均有此种情况出现,即使是大家都觉得很确定的蛋白很多时候也会出现不同的亚型.毕竟对很多蛋白我们的认识有限.这种情况不要怕的,尽管按照真实结果去处理,千万不要为了让结果好看或者符合大家的意思而去做修改.
3.实验技术的原因:曝光的时候会有底片轻微移动的现象,出现很接近的两条.
4.目的蛋白部分降解,也可能会出现相近的两条带.如何去掉杂带?我觉得你先找找你的目的蛋白的分子量,这样就能分辨出那个条带是你像要的.尽量减少蛋白的降解在样品的处理过程中.
杂带:若是多克隆抗体或是抗体浓度过高就可能有杂带.但是目的条带也会在其中,除非你的样品中靶蛋白表达过低才会出现没有目的条带的情况,封闭时间不够也可能出现杂带
总之,只要目的条带有出现,或者在附近都是没有问题的.此外,还可以再做mRNA进一步验证.祝您实验顺利.

WB杂出来的actin为什么两条带